Vorhersage der Proteinstruktur - Fortschritte bei Computermethoden und ihre Anwendung in der molekularen Modellierung
Fouad Sabry
Translator Daniel Hueber
Publisher: Eine Milliarde Sachkundig [German]
Summary
Proteinstrukturvorhersage-Dieses Kapitel stellt die grundlegenden Konzepte und die Bedeutung der Proteinstrukturvorhersage vor und bereitet den Boden für die folgenden Diskussionen. Alpha-Helix-Der Schwerpunkt liegt auf der Alpha-Helix, einem der häufigsten Strukturmotive in Proteinen, und ihrer Rolle für deren Stabilität und Funktion. Beta-Faltblatt-Erforscht die Beta-Faltblattstruktur, ihre Entstehung und ihren Beitrag zur Tertiärstruktur und biologischen Funktion des Proteins. Proteinsekundärstruktur-Befasst sich mit den verschiedenen Sekundärstrukturelementen von Proteinen und erklärt ihren Einfluss auf Proteinfaltung und -stabilität. Proteintertiärstruktur-Erläutert die dreidimensionale Anordnung von Sekundärstrukturelementen und die Kräfte, die diese Struktur stabilisieren. Membrantopologie-Dieses Kapitel behandelt die Vorhersage von Membranproteinstrukturen und ihre komplexen Wechselwirkungen mit Lipiddoppelschichten. Strukturelle Ausrichtung-Führt Techniken zur Ausrichtung von Proteinstrukturen ein, die für den Vergleich und die Gegenüberstellung homologer Proteine unerlässlich sind. Strukturelle Bioinformatik-Ein Blick auf die computergestützten Werkzeuge und Methoden zur Vorhersage und Analyse von Proteinstrukturen. Proteinstruktur-Bietet einen Überblick über die verschiedenen Ebenen der Proteinstruktur und deren Zusammenhang mit der Funktion. Proteindesign-Erläutert die Prinzipien und Methoden des Designs von Proteinen mit spezifischen Funktionen mithilfe computergestützter Verfahren. Gitterprotein-Erforscht das Konzept von Gittermodellen in der Proteinfaltung und hilft zu verstehen, wie Proteinstrukturen entstehen. Threading (Proteinsequenz)-Einführung in Threading-Techniken zur Vorhersage von Proteinstrukturen basierend auf Sequenzähnlichkeiten mit bekannten Strukturen. Proteinkontaktkarte-Konzentriert sich auf die Verwendung von Kontaktkarten zur Vorhersage von Proteinfaltung und -interaktionen. Turn (Biochemie)-Erläutert die Rolle von Turns in Proteinstrukturen, ihre Entstehung und ihre Bedeutung für die Proteinstabilität. Homologiemodellierung-Dieses Kapitel untersucht den Prozess der Erstellung dreidimensionaler Proteinmodelle basierend auf Sequenzhomologie. Loop-Modellierung-Konzentriert sich auf die Techniken zur Modellierung von Loop-Regionen in Proteinen, die für Funktion und Stabilität entscheidend sind. De-novo-Proteinstrukturvorhersage-Bietet einen detaillierten Einblick in Ansätze zur Vorhersage von Proteinstrukturen ohne homologe Vorlagen. Proteindomäne-Erläutert den modularen Charakter von Proteinen und die Bedeutung von Proteindomänen für deren Struktur und Funktion. Phyre-Eine Fallstudie des Phyre-Servers, eines weit verbreiteten Tools zur Vorhersage von Proteinstrukturen, mit Erläuterung seiner Anwendungen und Methoden. Proteinsuperfamilie-Einführung in das Konzept der Proteinsuperfamilien und ihre Bedeutung in der Evolutionsbiologie und funktionellen Vorhersage. ITASSER-Eine detaillierte Erläuterung des ITASSER-Tools, einer leistungsstarken Methode zur Vorhersage von Proteinstrukturen, die mehrere Techniken integriert.
Available since: 03/14/2025.
Print length: 287 pages.
